A formação madeirense foi uma das grandes sensações dos “play-offs”, ao afastar os russos do Zenit (4-3 em casa e 1-1 em St. Petersburgo), mas está no Pote 4, já que tem o quinto pior coeficiente entre as 48 participantes.

Desta forma, o Nacional poderá ter pela frente equipas poderosas como Werder Bremen, Villarreal, AS Roma, PSV Eindhoven, Shakhtar Donetsk, Hamburgo, Valência, Panathinaikos, Ajax e Steaua de Bucareste, os parceiros dos dois “grandes” lisboetas no Pote 1.

Por seu lado, Benfica, que eliminou o Vorskla Poltava nos “play-off” (4-0 em casa e 1-2 fora) e Sporting, afastado da Liga dos Campeões pela Fiorentina (2-2 em casa e 1-1 fora), evitam estas formações, mas podem, ainda assim, vir a ser incluídos em grupos complicados.

Everton, Lázio, Celtic, Fenerbahçe, Lille e Galatasaray são as equipas a “evitar” do Pote 2, enquanto o “pote 3” também tem formações de grande valia, como Hertha de Berlim, Athletic de Bilbau ou Fulham.

No pote 4, o do Nacional, também existem conjuntos fortes, casos de Toulouse ou Génova.
Os encontros da fase de grupos realizam-se a 17 de Setembro (primeira jornada), 01 de Outubro (segunda), 22 de Outubro (terceira), 05 de Novembro (quarta), 02 ou 03 de Dezembro (quinta) e 16 ou 17 de Dezembro (sexta).

Os dois primeiros de casa agrupamento qualificam-se para os 16avos-de-final (18 e 25 de Fevereiro de 2010), para os quais também seguem os terceiros classificados dos oito grupos da fase de grupos da Liga dos Campeões.

Os oitavos-de-final estão marcados para 11 e 18 de Março, os quartos-de-final para 01 e 08 de Abril, as meias-finais para 22 e 29 de Abril e a final para 12 de Maio, na Arena de Hamburgo, na Alemanha.

- Potes para o sorteio da fase de grupos da Liga Europa, que se realiza sexta-feira, no Mónaco:

Pote 1
 Werder Bremen, Ale (91.339 coeficiente UEFA).
 Villarreal, Esp (80.853).
 AS Roma, Ita (78.582).
 PSV Eindhoven, Hol (75.862).
 Shakhtar Donetsk, Ucr (74.370).
 SPORTING, POR (68.292).
 Hamburgo, Ale (67.339).
 BENFICA, POR (64.292).
 Valência, Esp (59.853).
 Panathinaikos, Gre (56.633).
 Ajax, Hol (54.826).
 Steaua Bucareste, Rom (53.781).

Pote 2

Fenerbahce, Tur (52.445).
 Basileia, Sui (51.050).
 Lille, Fra (47.033).
 Celtic, Esc (40.575).
 Everton, Ing (35.899).
 Club Brugge, Bel (34.065).
 Heerenveen, Hol (33.826).
 Galatasaray, Tur (33.445).
 Anderlecht, Bel (32.065).
 Austria Viena, Aut (31.565).
 FC Copenhaga, Din (26.890).
 Lázio, Ita (26.582).

Pote 3
 Hertha Berlim, Ale (26.339).
 Dínamo Bucareste, Rom (25.781).
 AEK Atenas, Gre (25.633).
 Slavia Praga, Che (25.150).
 Sparta Praga, Che (25.150).
 Levski Sófia, Bul (24.250).
 Athletic Bilbau, Esp (23.853).
 Partizan, Ser (23.050).
 Hapoel Telavive, Isr (18.050).
 Twente, Hol (17.826).
 Dinamo Zagreb, Cro (16.466).
 Fulham, Ing (15.899).

Pote 4
 CSKA Sófia, Bul (14.250).
 Toulouse, Fra (14.033).
 CFR Cluj, Rom (13.781).
 Génova, Ita (12.582).
 Rapid Viena, Aut (8.565).
 FC Timisoara, Tur (7.781).
 BATE Borisov, Bie (7.733).
 NACIONAL, POR (7.292).
 Salzburgo, Aut (6.565).
 Sturm Graz, Aut (3.565).
 Ventspils, Let (2.832).
 Sheriff, Mda (1.333).